想要在暗部段位取得优势，选择合适的忍者至关重要。宇智波斑秽土转生和宇智波斑白面具是当前版本中较为强势的选择，前者擅长打断敌方奥义并造成高额伤害，后者则在前两回合内能有效压制对手奥义释放。红莲之瞳作为追打输出核心，配合恶狼套装可反复打断对方奥义，形成持续压制。这类忍者组合能适应SS级难度任务，但需注意根据自身战力调整阵容搭配。
暗部任务中，打断敌方奥义是制胜关键。宇智波鼬秽土转生与猿飞日斩秽土转生的奥义组合能实现多回合控制，配合佐井忍界大战的墨迹效果可限制对手普攻。大野木忍界大战的被动技能可封锁敌方奥义释放，形成战术压制。选择这类忍者时需注重技能衔接与时机把握，避免因操作失误导致战术链断裂。阵容中建议配备赤色岩拳等提供护盾的辅助角色，以增强生存能力。
对于资源有限的玩家，可优先培养功能性较强的A级忍者。秽土迪达拉等A忍在特定场合表现优异，其性价比高于部分S忍。新手建议通过月卡积累资源，将金币和高招券保留用于高招首付活动。暗部特训忍具需均衡兑换，整套忍具平均升至3、6、9、12级时可获得额外加成。叛忍护额应优先用于提升暗部等级，以解锁更高属性加成和秘技。
在实战中需注意敌方三船等首领的特殊机制，其不吃常规控制但可被我爱罗的封普攻限制。偶数回合小兵奥义需用千手柱间等群体打断角色应对。阵容站位会影响战术执行，例如风主居中可减少起手机会防止敌方涨豆。追击线索选择需结合实际阵容，5号线索和10号线索在多数情况下收益较高。最终阵容强度取决于忍者练度与操作水平，建议通过反复练习掌握核心忍者的技能衔接节奏。
