晓组织的分崩离析源于多重因素的交织，包括内部成员的异质性、领导层的理念冲突、外部势力的干预以及组织目标的扭曲。最初由弥彦、长门和小南创立的晓组织，本意是实现忍界和平，但在弥彦死后，长门被仇恨驱使，与带土合作，使组织蜕变为以尾兽兵器征服世界的邪恶集团。这种核心理念的转变埋下了分裂的种子，成员们各怀目的，缺乏统一信仰，最终导致组织从内部瓦解。
晓组织的成员构成复杂，既有追求艺术的迪达拉和蝎，也有信仰邪神的飞段、贪财的角都，以及被利用的宇智波鼬和鬼鲛。他们的加入动机各不相同，有的为庇护，有的为私利，甚至有人是卧底。这种松散的利益联盟难以形成凝聚力，尤其在执行尾兽抓捕任务时，成员更倾向于单独行动或搭档内斗，而非协作。例如角都曾因赏金杀害队友，而带土则以阿飞身份潜伏，伺机操控组织方向。成员间的信任缺失加速了组织的分裂。
外部势力的持续打击也是晓组织崩溃的关键。五大国忍者联军在追踪尾兽线索时，逐步剿灭晓成员，如蝎死于千代婆婆和小樱之手，迪达拉自爆与佐助同归于尽，角都和飞段被鹿丸设计活埋。黑绝作为辉夜的意志产物，暗中推动带土和斑的计划，使晓沦为复活辉夜的棋子。长门被鸣人感化后牺牲，小南为保护长门遗体与带土同归于尽，核心领导层的消亡让组织彻底失去方向。
游戏中的晓组织玩法同样反映了其结构性缺陷。在火影忍者OL等作品中，晓标签的忍者虽拥有高强度技能，但需依赖特定阵容搭配才能发挥战力。例如佩恩六道中地狱道因功能重复常被舍弃，而不死二人组飞段与角都的组合虽能通过特殊机制存活，却容易被控场型阵容针对。玩家需注意，过度依赖个别成员会导致阵容容错率降低，这与晓组织实际覆灭的原因高度吻合。
其兴衰为玩家提供了深刻的策略启示：在组建团队时，统一的信念、合理的分工以及应对变数的能力缺一不可。
